Artículo 5º: La Comisión Nacional de Becas Indígenas tendrá las siguientes funciones:

a)  Proponer políticas de funcionamiento del Programa;

b)  Proponer y diseñar planes de mejoramiento del Programa cuando fuere necesario;

c)  Proponer y diseñar orientaciones, mecanismos y criterios globales para la postulación, renovación, pago y sistemas de control de las Becas Indígenas;

d)  Proponer el diseño y la implementación de la difusión del Programa;

e)  Proponer orientaciones a las Comisiones Regionales del Programa; y

f)  Proponer al Director Nacional de la Junaeb una distribución regional proporcional del presupuesto.